A biorremediación es todo proceso mediante el cual se busca la recuperación de sitios contaminados empleando organismos (plantas, hongos y bacterias) o enzimas; su técnica consiste en estimular los microorganismos nativos para degradar el contaminante a compuestos menos tóxicos que forman biomasa y dióxido de carbono (mineralización). En algunas condiciones la degradación del contaminante se da en el ambiente sin intervención humana, a través de un procedimiento conocido como “atenuación natural” (AN). La AN es el conjunto de procesos físicos, químicos y biológicos (biodegradación intrínseca) que reducen la concentración, masa y toxicidad del contaminante en el ambiente. Sin embargo, las tasas de degradación durante la AN son lentas y la mayoría de las veces es necesario acelerar estos procesos empleando biorremediación activa.

Por medio de la biorremediación activa se identifica el factor limitante del proceso para suministrarlo al ambiente (bioestimulación). La biorremediación se basa en los procesos metabólicos de los organismos y en la forma como estos utilizarán el contaminante. Los principales factores limitantes son el correcto balance de masas de los aceptores de electrones (como oxígeno y nitrato), donadores de electrones y nutrientes, así como el pH, la humedad y la disponibilidad del contaminante.